本发明提供了一种基于碰撞风险的机场跑道进离场程序下，跑道区域无人机管控区边界的确定方法，该方法包括：S1依据跑道进离场程序运行数据和碰撞风险概率e，航段曲线s∈[0，s1]，建立管控区边界划设模型；S2根据管控区边界划设模型，设置迭代终止阈值，通过迭代求解方法求解航段曲线的弧长参数s1近似解。本发明采用该方法划设跑道区域的无人机管控区，以确保在不影响民航飞机运行安全与效率的前提下，实现对民用无人机管控区的精准划设，为无人机的精细化运行管理提供技术支撑。