本发明公开了一种除去弱吸水性离子液体中微量水分的方法，具体步骤为：将惰性气体以鼓泡的方式从底部通入弱吸水性离子液体中对弱吸水性离子液体进行夹带除水，从弱吸水性离子液体中逸出的惰性气体与亲水性离子液体接触进行吸附脱水后重新通入弱吸水性离子液体中利用，吸水后的亲水性离子液体进行再生脱水后重新利用。本发明的除去弱吸水性离子液体中微量水分的方法可以大大缩短除水时间，除水效果好，对离子液体无污染，能耗低。本发明还公开了一种除去弱吸水性离子液体中微量水分的系统，包括惰性气体储罐、加热搅拌罐、吸收塔、亲水性离子液体回收罐及亲水性离子液体储罐。本发明的除去弱吸水性离子液体中微量水分的系统结构简单，操作方便。