本发明公开了一种直接甲醇燃料电池系统，包括：保温壳体、二次电源、电热装置、燃料混合室、液泵、气泵、燃料电池电堆和水热管理装置，二次电源能够在燃料电池系统启动时为系统提供所需要的电能，待系统运行后反向为其充电，并在燃料电池发热时作为电能储存装置，燃料电池电堆是以甲醇水溶液为燃料，利用其与氧气反应产生电能。其中直接甲醇燃料电池通过由外部供给的氧气与甲醇之间的电化学反应发电，具有燃料洁净环保、电池结构简单、高比能量等特点，本系统通过将燃料电池的废热变废为宝，将耗电的传统风冷装置，改为系统保温循环散热，将燃料电池的热能储存，并进行利用，最终实现在低温环境下可长时间储存使用。