本发明提供一种基于光注入技术的双通道微波光子滤波器及滤波方法，基于光注入技术的双通道微波光子滤波器包括：主半导体激光器、双输出电光调制器、第一光环形器、第一从半导体激光器、第二光环形器、第二从半导体激光器和平衡探测器；主半导体激光器的输出端与双输出电光调制器的光输入端连接；双输出电光调制器的输出端分别与第一光环形器的第一接口和第二光环形器的第一接口连接；第一光环形器的第二接口与第一从半导体激光器连接，第一光环形器的第三接口与平衡探测器第一输入接口连接；第二光环形器的第二接口与第二从半导体激光器连接，第二光环形器的第三接口与平衡探测器第二输入接口连接。本发明能实现双通道宽带可调谐微波光子滤波。