本发明公开一种双头泵系统和净水器，其中，双头泵系统包括双头泵，包括泵体及分设于泵体两端的第一泵头和第二泵头，第一泵头上设有第一进水端和第一出水端；第二泵头上设有第二进水端和第二出水端，第一进水端和第二进水端连通进水管路，第一出水端和第二出水端连通出水管路；以及增压回路，设有第一控制阀，增压回路的进水端连通第二出水端，出水端连通第一进水端；双头泵系统具有第一模式和第二模式，当增压回路断开时，双头泵系统处于第一模式，当增压回路导通时，双头泵系统处于第二模式。本发明双头泵系统通过设置具有第一控制阀的增压回路，使得第一控制阀控制增压回路断开或导通，从而使得双头泵系统具有第一模式和第二模式。