本发明提供一种突发公共卫生事件应急处置系统，包括：数据采集模块，用于采集所在区域当天的每个科室的第一应急数据组和所在区域的特征标签；数据处理模块，用于每天接收当天采集的第一应急数据组和特征标签，确定应急预案库中与第一应急数据组相关性最高的第二应急数据组，并从应急预案库中获取与所述第二应急数据组对应的应急预案，还用于分别针对所述应急预案，根据其针对的区域的特征标签，调整该应急预案，并将调整后的应急预案用于应对其对应的区域。通过上述技术方案，解决了目前针对突发公共卫生事件编制的预案无法满足复杂突发事件发展变化的实际应急处置需求的技术问题。