本发明提供一种太阳耀斑的预警方法、系统、计算机可读存储介质及设备，所述预警方法包括：获取最新的太阳X射线数据文件；读取所述太阳X射线数据文件，并建立与太阳耀斑关联的时间序列；根据与太阳耀斑关联的时间序列，获取用于计算太阳耀斑的预测峰值通量的计算参数，以计算太阳耀斑的预测峰值通量；其中，所述计算参数包括X射线通量变化的极大值和太阳耀斑的动态背景通量；查找所述动态背景通量的第一发生时刻及太阳耀斑的预测峰值通量的第二发生时刻，以根据所述第一发生时刻和所述第二发生时刻预测耀斑峰值的预测发生时刻。本发明首次实现了由实际X射线探测数据对太阳耀斑的定量化预警，可以更好地为用户提供保障。