本发明提供了一种畜禽舍内自动喷雾消毒系统，包括加水装置、加药装置、喷雾装置、监测装置与检测装置，加水装置包括水箱，水箱通过进水管连接有水泵，加药装置包括药桶，药桶通过进药管连接有吸药阀，吸药阀一端连接有进液管，进液管连接有高压微雾泵，高压微雾泵的输出端连接有出液管，出液管连接雾管，雾管上均匀布设有若干喷头，监测装置包括PM2.5监测仪，PM2.5监测仪通过控制模块连接有电磁阀，电磁阀设置于出液管管体。本发明的有益效果为：设计合理，结构简单，安全可靠，可自动进行舍内的空气加湿除尘，从而降低禽舍环境中微生物气溶胶的含量，最终达到健康养殖的目的。