本发明公开了一种利用小分子抑制剂SP600125制备染色体标本的方法，采用SP600125对鱼类或哺乳动物的离体培养细胞或鱼类活体组织进行处理，结合低渗、固定以及制片染色后，即得到染色体标本。该方法制备过程简单、容易控制，制备周期短；SP600125将细胞周期阻断在分裂的早后期，染色体标本分裂相多、染色体结构清晰且形态良好，适用于染色体核型分析、显带技术和染色体原位杂交等研究实践；同时，极大地降低了常规染色体标本制备中使用剧毒性秋水仙素所存在的严重实验安全隐患。