本发明公开了一种特异性识别牛妊娠相关糖蛋白（bPAG）的核酸适配体及其应用。所述核酸适配体的序列为以下SEQ IDNo.1序列所示的DNA片段或SEQ IDNo.2序列所示的DNA片段，同时公开了核酸适配体衍生物，由所述核酸适配体序列进行骨架修饰或碱基改造，得到与该核酸适配体相同功能的核酸适配体衍生物。本发明的核酸适配体是通过磁珠‑SELEX技术筛选得到，能特异性结合bPAG蛋白家族，与其他蛋白不发生特异性结合，易于合成和修饰，可用于从复杂体系中捕获bPAG蛋白，适用于bPAG蛋白的检测、分离纯化及家畜早孕快速诊断，应用前景广阔。