本发明公开了一种防治金线莲茎腐病的解淀粉芽孢杆菌及其应用，属于农作物病害防治技术领域。所述菌株为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)GZ5，已于2019年11月21日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心登记保藏，保藏号为CGMCC No.18987。本发明所述的菌株GZ5是从福建省光泽县健康番茄根围土壤中获得，与土壤生态和谐相容，无毒、无致病性。所述解淀粉芽孢杆菌GZ5菌株经平板对峙试验筛选获得，能够有效抑制金线莲茎腐病菌菌丝生长及孢子萌发，且与环境相容性好，具有良好的开发应用前景。