本发明公开了一种药品申报文档的智能归档方法，包括识别归档所参照的标准规范文件，确定所述标准规范文件各目录关键字并打包形成规则库；选择归档所需至少一个规则库并对所选规则库设置规则库优先级；获取需编排的药品申报文档列表，识别文档标题和文件内容，并进行文档关键字提取；根据规则库优先级依次对各药品申报文档进行关键字和/或特定关系匹配，对匹配到相应规则库的药品申报文档进行编排处理后归档至相应目录中。达到各类型文档自动编排到相应目录的效果，实现了灵活选取相应的规则库进入快速文件归档的效果，极大的提高了药品申报的速度。