本发明涉及农业生物技术领域，具体地，具体涉及一种共表达溶菌酶和木聚糖酶的方法、及制备作为替代抗生素的饲料添加剂的方法。所述方法包括在毕赤酵母中同时表达核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的溶菌酶酶基因和核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的木聚糖酶基因的步骤。根据本发明，经诱导表达后同时分泌表达木聚糖酶和溶菌酶两个蛋白，通过重组木聚糖酶的活力大小来判断溶菌酶产量的高低，快速筛选高表达溶菌酶的重组菌，表达产物可以被应用于饲料添加剂。