本发明公开一种玉米根系采样装置，包括前壳和后盖，在前壳上开设有凹槽，壳体底部开设有第一通孔，第一通孔与所述凹槽相连通，前壳内设置有承重板，承重板上方设置有驱动机构和喷淋机构，承重板下方设置有若干个伸缩按压部，所述伸缩按压部下方设置有铁铲铁铲上设置有摆动部摆动部和所述伸缩按压部接触连接；本发明不仅可以保证铁铲的入土角度也可以保证入土深度，进而保证对玉米根系的挖取，同时采用喷淋机构可以对玉米根系进行清洗，这样更有利于对玉米根系的采样，此外，本发明公开的采样装置对玉米农田环境中的根系的损害度降到最低，为了后期对污染物的测定减小误差可供在系统中分析提供有效、可行、可靠的采样装置。