本发明属于军航空管自动化技术领域，具体涉及一种飞行情报系统间航线传输与处理方法。本发明技术方案通过用户航线航段信息和完整航线航段信息的分别处理实现了即按用户习惯进行航线操作，又满足系统间数据交互的完整性需求；通过对航线数据进行签名和加密操作，确保了数据的保密性、完整性和可用性。实现了无需基础数据库的军民航管制中心飞行情报系统间航线传输与处理能力。与现有技术相比较，本发明技术方案能够准确、无误的进行航线处理，尤其对于军民航管制中心内基础数据名称重复、基础数据缺失、基础数据错误时的处理有明显优势，在通航飞行计划及无人机飞行计划的航线处理方面也具有很强的适用性。