本发明公开了一种配电网同母线变关系异常诊断方法、装置及系统，包括计算出原属于某馈线的各配变的功率占比，按照功率占比顺序对配变排序；按照配电排序进行：计算出配变原始功率数据在各设定的时间窗内的方差，取方差最大时间窗为典型变化时间窗，典型变化时间窗内的配变原始功率数据为典型功率特征数据；计算典型变化时间窗内配变典型功率特征数据与各馈线的功率数据的相关系数指标值，将配变修正到最有可能所属的馈线，若修正后所属的馈线与原始所属的馈线不同，判定该配变在同一母线下不同馈线相互之间挂接错误。本发明计算简单，能够帮助运行人员及时发现同一母线下不同馈线相互之间存在的线变关系错误，进一步挖掘配网信息，具有良好的应用前景。