本发明涉及电力系统可持续发展领域，具体公开了一种核算电力系统虚拟水传输方法及系统，首先采集各省份投入产出表、电力交易年报的电力交易数据,其次结合全生命周期和投入产出法，计算各种发电形式的耗水强度；然后统计每个省份的发电结构数据，根据发电结构数据和各种发电形式的耗水强度计算出每个省份的综合耗水强度；再将所述省份的电力交易数据，且考虑到高阶投入产出矩阵的影响，将电力交易矩阵转换为完全交易矩阵；最后将省份间的电力交易数据乘以省份的消费侧电力耗水系数，从而得到省份间电力系统的虚拟水。本发明获取数据简单，且考虑了高阶矩阵的影响，使得电力系统中虚拟水的计算更为准确，可为电力系统环境评估提供帮助。