本发明涉及功能涂层技术领域，公开了一种防海洋生物污损的透明薄膜的制备方法，包括步骤：将透明改性粉末形成气溶胶，经过滤器过滤；在加速气体作用下沉积于基体表面；基体表面后处理后获得所述透明薄膜；该透明改性粉末为氧化铝、氟化钙、钇铝石榴石、氧化铟锡等透明陶瓷颗粒与抗污剂的改性物。该方法能够在室温下于基体表面沉积均匀致密的透明薄膜，该薄膜厚度可控且与基体结合良好，具有有效地防污损与增透光性能，且由于致密结构中分布的广谱抗污剂分子缓释的作用，可实现长效的防海洋生物污损效果，可应用于多种海底监测水下光学窗口、传感器、摄影镜头等透光材料表面防污领域。