本发明公开了一种检测α-地中海贫血的核酸组合物、其基因芯片、其试剂盒及其应用，涉及生物技术领域，该核酸组合物其包括探针组合1、探针组合2和探针组合3，能同时检测10种α-地中海贫血基因类型，缺失型α-地中海贫血基因类型(--SEA、-α3.7、-α4.2、--THAI、--FIL)和非缺失型α-地中海贫血基因类型(包括3种点突变型α-地中海贫血基因类型(αCSα、αQSα、αWSα)和三联体型α-地中海贫血基因类型(αααanti3.7、αααanti4.2)，各探针的Tm值相近，能同时进行与样本的杂交反应，不会因为温度的问题而影响杂交的结果，检测的准确性好。