本申请涉及变电站一次设备和二次设备的实时仿真运行方法及系统，包括：构建实时数据库，用于变电站一次设备仿真运算与变电站二次设备仿真运算的实时数据交互；当收到完成一次设备当前仿真步长的仿真运算响应信号时，通过实时数据库读取一次设备仿真运算结果数据，执行二次设备仿真运算；将二次设备仿真运算结果数据，以及二次设备仿真过程中的保护动作执行结果数据存入实时数据库，用于变电站一次设备仿真过程中，根据二次设备仿真保护动作执行结果，读取二次设备运算结果数据，执行下一仿真步长的仿真运算。