本发明公开了一种净化海水池塘养殖尾水中无机氮磷的赤红球菌HDRR1，赤红球菌HDRR1(Rhodococcus ruber HDRR1)，保藏名称为赤红球菌HDRR1，保藏编号为CCTCC M20191008，保藏日期为2019年12月4日，保藏单位为中国典型培养物保藏中心，保藏地址为中国武汉。该菌株HDRR1对养殖尾水无机氮磷具有较强的净化能力，且环境适应性良好，对养殖鱼虾无不良影响。还公开了上述赤红球菌HDRR1在净化海水池塘养殖尾水中无机氮磷方面的应用。