本发明提供了一种聚缩醛树脂的制备方法。包括以下步骤：三聚甲醛与共聚单体环醚和/或环状缩醛、至少具有2个环氧基团的缩水甘油醚以及缩醛类链转移剂通过杂多酸催化剂引发聚合反应，然后经过与失活剂含硫官能团的噁唑衍生物反应挤出后得到。在聚合反应的特定阶段加入环醚和/或环状缩醛与至少具有2个环氧基团的缩水甘油醚混合物能够以简单地工艺实现该缩水甘油醚在聚缩醛主链的有效接入，并且通过改善失活工序，与失活剂含硫官能团的噁唑衍生物进行混合后，反应挤出，提高聚缩醛树脂的热稳定性与各项力学性能。