本发明公开了一种换流站近区短路电流的控制方法及系统，包括：建立柔性直流换流站VSC接入电网近区的电磁暂态仿真模型，并初始化设置柔性直流输电系统的站级控制方式；判断在当前的控制方式下，柔性直流换流站近区站点的母线短路电流是否大于预设的短路电流阈值，并获取第一判断结果；当第一判断结果指示大于预设的短路电流阈值时，切换所述柔性直流换流站近区的无功功率的控制方式为定无功功率0Mvar。本发明通过调整柔性直流换流站的无功控制方式，改变柔性直流换流站短路故障期间贡献电流幅值/相位，通过柔性直流贡献电流分量同交流短路电流分量矢量叠加关系的改变，抑制换流站近区短路电流水平，改善了柔性直接入电网后换流站近区短路电流超标的问题。