本发明公开了一种利用线粒体分子标记鉴定茶蚜的方法及其应用，属于分子生物学技术领域，该分子标记包括以下引物：F：5’‑TGGAACAGGAACAGGATGAACT‑3’；R：5’‑ACTCCTGTTAATCCTCCGATTGT‑3’；该线粒体分子标记具有稳定性好、多态性高、重复性好，并且经过扩增后的条带清晰易读，可有效应用于茶蚜鉴定、DNA指纹图谱构建及遗传多样性评价与系统发育研究等领域，为茶蚜分子标记辅助选择提供了新的工具，具有良好的应用前景。