本发明公开了一种花药培养与离体染色体加倍结合快速选育水稻新品系的方法，其步骤包括：a.不同水稻品种间杂交获得杂种；b.杂种种植及花药培养取材；c.材料低温预处理；d.花药培养获得愈伤组织；e.愈伤组织离体染色体加倍；f.加倍后愈伤组织恢复培养；g.愈伤组织分化出苗；h.芽苗生根培养；i.试管苗移栽；j.倍性鉴定；k.综合性状鉴定。与传统经花药培养成愈伤组织、愈伤组织分化形成植株，再对鉴定确认的单倍体植株活体染色体加倍的选育方法相比耗时短、效率高。本发明直接利用愈伤组织进行离体染色体加倍，愈伤组织分化获得植株后，能高效快速获得所需性状的纯合水稻新品系。为利用花药培养途径培育水稻新品系走出了一条新路。