本发明公开了一种配电网小电流接地故障定位方法及系统，方法包括以下步骤：步骤1：检测零模电流突变量，当零模电流突变量超越预设门槛时，启动录波，并记录故障发生时刻暂态零模电流数据；步骤2：就地对故障录波数据进行简化处理，提取零模电流特征轮廓；步骤3：从故障线路第一个区段开始作为待定区段，对故障线路各监测点零模电流特征轮廓数据进行比较，判定故障点所在线路区段。本发明将暂态零模电流录波数据简化处理后上传定位主站，可实现配电系统小电流接地故障的有效定位，并且有效减少数据传输与定位主站计算量，适用于中性点采用小电流接地方式的配电系统，解决了配电网小电流接地系统中发生单相接地时的故障定位问题。