本发明提供一种基于人工智能的多元异构网络数据可视化方法及系统，其中，方法包括：步骤S1：构建三维多元异构网络拓扑图；步骤S2：获取多元异构网络数据；步骤S3：解析多元异构网络数据，确定第一可视化数据和数据内容；步骤S4：将数据内容输入预先存储的神经网络模型，获取第二可视化数据；步骤S5：基于第一可视化数据和第二可视化数据，在三维多元异构网络拓扑图中进行标注。本发明的基于人工智能的多元异构网络数据可视化方法，实现用户可以直观地观察出异构数据源之间的数据流向、代表数据表征信息的数据类型及数据风险性。