本申请实施例公开了一种公共卫生系统与医疗系统互通系统及方法，其中方法包括：公共卫生系统存储健康档案数据包，并将所述保存的健康档案数据包上传至内网共享服务器；内网共享服务器存储所述公共卫生系统上传的所述健康档案数据包，并将所述健康档案数据包发送至医疗系统服务器；医疗系统服务器获取病历数据，并接收并存储所述内网共享服务器发送的所述健康档案数据包，在检测到推送指令的情况下，共享所述健康档案对应的病历数据至所述公共卫生系统，并通过禁止协议禁止向所述内网共享服务器发送数据。