本发明提供一种网络传输异常的定位系统和方法，该方法包括：周期采集网络中各节点的日志信息，当节点在业务交互时，若所处理的协议状态为告警状态，则采集此刻与前一个周期采集时间点之间的告警日志信息；将告警日志信息与已采集的日志信息合并，并向前一时间段溯源；将告警日志信息与下一个周期采集时间点的日志信息合并得到完整衔接时间段的日志信息，并向后一时间段溯源；将前序溯源链路和后序溯源链路拼接得到完整溯源链路，根据告警日志信息和完整溯源链路确定网络传输异常节点、直接关联节点和异常起始节点；该方法能够将网络传输异常定位到协议级，并能够溯源异常发生的传输路径，进而能够获取直接关联节点以及造成异常的起始节点。