本发明公开了一种水生植物生境模拟系统，包括挺水植物种植架、位于所述挺水植物种植架下方的沉水植物种植板，所述挺水植物种植架与沉水植物种植板通过高度调节杆相连；所述挺水植物种植架的端部设有浮体，用于拖浮挺水植物种植架；所述挺水植物种植架中间设有用于漂浮植物养殖的漂浮植物种植网。本发明的水生植物生境模拟系统由挺水植物种植架、可调节沉水植物种植架与沉水植物种植板之间距离的高度调节杆、以及漂浮植物种植网构成，整个系统组成部件数量少，不同类型水生植物种植密度可以调节，沉水植物的种植深度可以精确控制，且不会随应用场地水位变动而发生变化。实际使用过程中，可以开展不同种类水生植物及影响因素的组合。