本发明公开了一种辅助治疗脓毒症胃肠功能障碍的灌肠中药及其制备方法与应用，该灌肠中药包括以下重量份组分：寒水石6-18份、滑石7-26份、木香2-8份、大黄2-14份、石膏12-60份、厚朴2-12份、丹皮4-12份、枳实2-12份、诃子1-8份。本发明的灌肠中药可以采用中药制剂的常规方法制备成任何常规灌肠制剂，服用方便；本发明的灌肠中药对脓毒症胃肠功能障碍具有良好的治疗效果，能够降低脓毒症胃肠功能障碍患者的死亡率，延长患者生命；同时可改善脏器功能，防止、逆转多脏器功能衰竭的发生。