本发明提供一种风扇自动控制方法及系统。风扇自动控制系统包括第一开关、温度感应器和生物感应器，温度感应器内设有第二开关,第一开关与设定的风扇电连接，该方法包括：温度感应器对设定区域内的环境温度进行采集，并判断设定区域内的环境温度是否高于预设温度；在设定区域内的环境温度高于预设温度时，导通温度感应器内的第二开关，并开启生物感应器；在生物感应器检测到设定区域内存在被检测生物时，导通第一开关以控制风扇启动运行。由此，根据被测区域的温度以及被测区域内是否存在被检测生物，控制风扇的运行，节约能源。