本发明属于计算机视觉技术领域，公开了一种配置目标跟踪硬件加速控制方法、系统、存储介质及应用，完成对感兴趣区域的提取以及样本标签值的计算；完成对感兴趣区域目标特征提取，根据目标特点，选择灰度特征、颜色特征或者HOG特征进行配置；对提取的目标特征通过不同的核函数进行滤波器的训练以及位置预测，配置为高斯核函数、线性核函数或者多项式核函数；根据目标是否发生空间上的位移，选择不同尺度的目标区域进行计算，对响应值进行比较，选择最优目标位置；利用当前帧的结果对滤波器的参数进行更新，可选择连续模型更新略或者阈值更新策略。本发明可以快速更新迭代，对于其他计算机视觉算法，有较强的可移植性。