本发明公开了标注管理方法及系统，该方法应用于数据移交系统，数据移交系统包括标注服务器和算法服务器，方法包括：通过标注服务器接收数据下载指令，获取数据下载指令对应的标注数据包；使用标注服务器对标注数据包进行加密操作，生成加密数据包并发送至算法处理器；响应于解密请求指令，根据预置的权限管理库对所述解密请求指令进行判定，当所述判定结果为解密请求指令为有权指令，则获取与解密请求指令关联的密码发送至算法处理器；通过密码对所述算法处理器的加密数据包进行解密操作，获取标注数据包。从而能够提高标注数据传输的安全性。