本发明公开了一种用于解决深井工作面多元灾害的巷道布置系统的通风方法，包括布置在工作面两侧的运输巷、轨道巷和布置在工作面下方的底板回风巷，所述轨道巷的顶板上设有多个通风眼，所述通风眼的上方连通所述轨道巷，所述通风眼的下方连通所述底板回风巷，在工作面回采过程中封闭轨道巷背对采空区的一端到工作面之间的通风眼，并打开位于采空区内的通风眼，轨道巷位于采空区内的部分通过通风眼连通底板回风巷。由此可以提升回风效率，不仅可以防止工作面上隅角瓦斯积聚发生瓦斯事故，而且可以降低工作面的温度，防止瓦斯温度过高发生危险，还能改善工人们的工作环境。