本发明涉及综合扫码仪与仓库管理系统的智能分拣货物数据处理系统、方法、以及存储介质，其包括：步骤S100：控制终端形成包裹编号信息分别发送至服务器和扫码仪；步骤S200：扫码仪拍照读取相应编号包裹的包裹条码，并发送包裹信息至服务器；步骤S300：服务器基于扫码仪所发送的包裹信息作解析，并基于解析结果采用相应策略：步骤S400：控制终端执行相应策略并获取相应包裹的包裹处理结果信息发送至服务器；步骤S500：服务器将包裹处理结果信息发送至客户端并于客户端显示统计结果。本发明不使用含RFID标签容器，而仅仅对货物直接进行扫码识别，然后进行货物分拣，这样大大降低了配套设备的成本、节约了时间成本、提高效率。