本申请提供了一种非接设备的侧信道信号采集系统，包括：读卡器、非接设备和与电磁线圈连接的信号采集设备；读卡器包括非接通信芯片和时钟输出装置；时钟输出装置，用于在预设程序控制下，输出载波参考时钟和采样时钟；采样时钟的频率是载波参考时钟的频率的整数倍；采样时钟的相位与载波参考时钟的相位间的差值为预设差值；非接通信芯片依据载波参考时钟控制天线模块产生初始载波信号；信号采集设备依据采样时钟采集目标载波信号的波峰值，和/或，波谷值，形成侧信道信号。本申请提高信号采集设备采集到的侧信道信号的准确性。