本发明公开一种串联变压器差动保护的闭锁方法，包括如下步骤：步骤1，分别采集串联变压器串联绕组首端电流I1、串联绕组尾端电流I2、并联绕组套管电流I3；步骤2，取Ii电流当前采样点，以及先于当前采样点的T时间段内所有采样点，构成数据样本Ai，i＝1,2,3；步骤3，分别确定I1、I2、I3的拐点标志及过零标志；步骤4，根据拐点标志及过零标志的取值，置串联变压器旁路衰减状态标志F为1或0；若当前采样时刻F为1，则从当前采样时刻起，在此后的tset2的时间段内闭锁差动保护。此种闭锁方法可克服串联变压器旁路合闸时存在的电流衰减特性不一致导致差动保护误动的问题。