本发明涉及一种高压配电网分区重构与储能协同的电网阻塞管控方法，包括以下步骤，S1：采集城市高压配电网及输电网的拓扑信息、交流节点信息、电力信息及配电网的分区信息；S2：建立储能电站双层规划模型，规划储能电站选址、容量及其功率；S3：构建上层输电网阻塞管控优化模型，获取各区域高压配电网最优转移容量；S4：构建下层区域单元组分组重构及储能充放模型，获取各区域高压配电网最优拓扑状态；S5：反馈调节当前时刻的储能系统有功出力；S6：根据各区域高压配电网最优拓扑状态，计算输电网中交流节点的有功负荷，根据输电网中交流节点的有功负荷，判断输电网是否还有阻塞状态。本发明具有快速有效消除输电网阻塞的优点。