本发明提供了一种具有协同抗凝及抗钙化功能的瓣膜材料及其制备方法，其制备方法包括以下步骤：对动物源生物瓣膜材料进行戊二醛交联处理；将处理后的瓣膜材料浸入含有胺基化合物的封闭液中处理0.5‑6h，进而封闭戊二醛交联后残留的醛基基团；然后瓣膜材料放入含有抗凝剂和交联剂的反应液中，于4℃‑37℃条件下交联处理6‑24h；最后对瓣膜材料进行清洗，制得，将瓣膜材料保存于戊二醛或异丙醇/丙三醇的混合溶剂中。该方法可有效解决现有方法制得的瓣膜材料存在的由于醛基残留引发的易钙化和形成血栓的问题，按照本方法制得的瓣膜材料可用作于主动脉瓣、肺动脉瓣、静脉瓣、二尖瓣及三尖瓣置换术所需的瓣膜材料。