本发明公开了一种混合动力车辆的起动机控制方法、系统及混合动力车辆，方法包括以下步骤：获取起机供电回路的状态参数，根据状态参数确定起机供电回路是否发生故障；获取起动机的起机模式，起动机起机模式包括行车起机模式和停车起机模式；若起动机采用行车起机模式且起机供电回路未发生故障，则控制起机开关断开，并对低压负载发出功率限制指令，经过第一预设时间，控制起动机起动发动机；若起动机采用停车起机模式且起机供电回路未发生故障，则控制起机开关保持闭合，并控制起动机起动发动机。本发明实施例提供的起动机控制方法有利于提高整车电压稳定性，避免起动机的起动电压降影响低压负载工作，降低生产成本，提升整车运行安全性。