本发明公开了一种河道泡漩结构识别方法，包括以下步骤：1)通过相机采集获取河道水面的图像数据，进行预处理并计算水面的单帧脉动速度场；2)通过单帧脉动速度场的散度特征确定当前泡漩中心位置；3)采用标准化泡漩速度场模板对泡漩区域散度场进行滤波，并选取合适阈值提取泡漩区域，得到当前泡漩边缘范围。本发明还公开了一种基于上述识别方法的河道泡漩结构识别跟踪方法，以及一种河道通航预警方法。本发明能够很好的应用于大尺度的天然河流泡漩结构识别与跟踪计算，提高了泡漩结构测量分析的过程便捷性和高效性，有助于快速获取河道内的碍航泡漩流态的运动及分布，为船舶航线规划和安全通航提供有力支撑。