本发明公开了一种新型的山区桩基桩长计算方法及其系统，所述方法包括，在获取的桩端持力层的等高线图中插入多个待计算桩长的桩位；根据输入的桩位圆心坐标、持力层等高线样条曲线的点坐标及搜索范围计算桩位圆心在搜索范围内距离桩位最近的两条等高线；根据两条等高线分别与桩位的距离及两条等高线的Z坐标属性，计算桩位的Z坐标；然后结合输入的桩顶标高及入持力层深度计算桩位的桩长；最后根据具有相同桩顶标高和入持力层深度的桩位，批量计算每个桩位的桩长。本发明提供的新型的山区桩基桩长计算方法，通过利用持力层等高线的数据和桩位与持力层等高线的距离，批量获得了山区桩基桩长，提高了桩长计算的效率和精度。