本发明公开了一种避免交流滤波器电容器不平衡电流过补偿的方法，包括依次检查高压直流是否停电，被检交流滤波器是否停电，被检交流滤波器电容器在检修中是否有调整，被检交流滤波器固有不平衡电流补偿值是否大于门槛值，年度检修期间投运前采用现场实验方法消除原固有不平衡电流补偿值；高压直流运行期不开展清除原不平衡补偿值的实验；交流滤波器投运后，限制不平衡电流补偿值。本发明通过交流滤波器投运前清除电容器原不平衡电流补偿值和限制补偿值的大小，避免交流滤波器电容器不平衡电流过补偿，减低保护误动风险。