本发明公开了一种布草自动分拣系统及其控制方法，包括运输线，在沿运输线运行方向依次布置有一系列检测装置包括第一编码扫描装置、第一缠结识别装置、第二缠结识别装置、布草种类识别装置、布草破损识别装置和第二编码扫描装置。采用多层分拣扫描装置，可自动将缠结布草分拣出来进行打散确保所有送入洗涤的布草是分散的，并按照布草的不同种类分别堆放，同时根据洗涤设备的洗涤能力对布草堆进行分割，便于后续能够提供有效且有针对性的洗涤。本发明不仅可以减少布草洗涤所需资源还能够确保布草的洗涤质量。