本发明提供一种用于水-气界面的气泡通量采集装置，该采集装置包括：支架本体，支架本体能够悬浮于水平面上；集气瓶，集气瓶设置于水平面以上，集气瓶的瓶口朝向水平面设置；集气罩，集气罩设置于水平面以下；与集气瓶的瓶口密封连接的进气管和排水管；进气管的第一端与集气瓶的瓶口连接，进气管的第二端通过一止水系统与集气罩的排气端连接，集气罩的进气端与支架本体的第二端连接。气泡通量采集过程中，集气罩中水体释放的气体通过止水系统进入进气管，并通过进气管进入集气瓶，集气瓶中的水从排水管排出，使得集气瓶中充满水体中释放的气体。该采集装置适用于风浪大、水深的环境下的气泡通量采集。