本发明提供一种用于智能配变终端的配置方法及系统，包括确定当前成功登录的用户的用户权限；显示与用户权限对应的用户操作界面；获取基于用户操作界面执行配置项目所对应的指令；若为配置安装操作指令，基于TTU需求信息生成同一批次待出厂的多个TTU所对应的安装文件，并保存；若为安装指令，获取安装配置文件，并与预先保存的安装文件中的MD5码进行匹配；若匹配，根据安装操作指令执行安装配置文件，对同一批次待出厂的TTU执行一键安装和配置操作。在本方案中，不需要人工逐一对配置项目进行安装，在获取到一键安装指令时，通过验证导入的安装配置文件与预先保存的安装文件中的MD5码是否匹配，从而确定安装微应用APP的版本，且能够提高安装配置的效率。