本发明公开了一种基于地质模型约束的井间砂体连通图自动绘制方法及系统，其中，该方法包括：依据解释层位和断层信息创建符合实际地质构造的二维地质模型，再使用生成的地质模型信息，对依据井的岩性和分层数据建立的初始砂体连通图进行砂体形态控制，使生成新的砂体连通图更加真实反映实际地质构造，该方法及系统可以通过测井分层、岩性和解释层位信息，在地震信息约束下，自动计算生成符合实际地质构造的砂体连通图，极大提高了地质绘图的工作效率和精度，为油藏地质分析提供有效直观的分析工具，为油田开发提供更可靠的数据支持。