本发明公开了一种确定调峰辅助服务费用分摊修正系数的方法及系统，所述方法包括：以保障性收购利用小时数为基准确定风光机组分摊修正系数，并计算参与分摊的风光机组修正后的发电量；根据所述风光机组修正后的发电量计算火电机组i分摊调峰费用；计算火电机组i的净调峰效用；使所述净调峰效用大于0及各机组单位未承担的调峰容量分摊费用相等，确定火电机组调峰辅助服务费用分摊修正系数。本发明提供的一种确定调峰辅助服务费用分摊修正系数的方法及系统，针对调峰市场费用分摊问题，在调峰费用分摊方法的基础上，按照收益度与分摊比成正相关原则，克服了现有技术中人为确定分摊修正系数进而导致分摊结果缺乏合理性的缺点。