本申请涉及一种大气中子辐射效应测试系统以及方法。其中，大气中子辐射效应测试系统包括样品台设备、信号输入设备、测试设备以及分析设备。样品台设备包括试验样品台以及控制模块，试验样品台用于放置电子系统，控制模块用于控制试验样品台运动。分析设备根据测试设备的测试结果分析被测器件的大气中子辐射耐受能力。因此，本申请大气中子辐射效应测试系统以及方法可以对电子系统的组成器件进行大气中子辐射耐受能力分析。同时，样品台设备可以带动电子系统运动，进而使得大气中子辐射效应测试系统在同一试验过程中对多个被测器件进行切换测试。因此，本申请的大气中子辐射效应测试系统以及方法可以有效提高电子系统的安全性、可靠性。